Elle est le savant qui peut en apprendre plus à Lyra sur la Poussière. Étonnée par les surprenants pouvoirs de l'aléthiomètre elle accepte de lui montrer le fruit de son travail (un ordinateur appelé « La Caverne ») permettant de communiquer avec les particules vivantes qui composent la Poussière. Lyra réussit à contacter la Poussière (qui lui répond de la même façon que son aléthiomètre) et explique à Mary qu'il faut reprogrammer l'ordinateur pour qu'elle puissent communiquer avec la matière sombre. Mary Malone reçoit la visite de l'homme aux sourcils blancs qui cherche à accéder à Will par l'intermédiaire de Lyra. Elle aide Lyra a s'enfuir et reçoit ensuite la visite de son collègue revenu. Lord Boréal contacte les deux savant (qui sont toujours en attente de subventions pour leurs recherches) et leur propose de l'argent en échange de quoi il doivent diriger leurs recherches sur le contrôle du cerveau. Mary refuse et démissionne. Peu après elle s'introduit dans son bureau, reprogramme l'ordinateur et entre en contact avec la Poussière (« les anges ») qui l'investissent d'une mission : « jouer le rôle du serpent au paradis sur Lyra et Will ». Ensuite il lui ordonne de détruire ses recherches (ce qu'elle fait en effaçant toutes les données) et elle part à la recherche de la tente où se trouve des provisions qui doivent lui permettent d'échapper aux spectres de Cittàgazze et part y accomplir sa mission.
Elle découvrira qu'elle a un dæmon (qui reste sans nom), un crave alpin : la forme qu'avait pris Lucifer avant d'entrer dans le Paradis d'Éden.
surligné ke si vous avé lu les 3 tome . Mary Malone sur le do du mulefa .